Am Staffelsee-Gymnasium bestehen ein Unterstufenensemble für die Jahrgangsstufen 5 bis 7 und ein klassisch orientiertes Orchester.  Zusammen mit den Chöre gestalten diese Instrumentalensembles ein Weihnachtskonzert und ein Sommerkonzert, das immer unter einem bestimmten Motto steht. Das Repertoire umfasst dabei den Bereich von Klassisch bis Modern. Zur Vorbereitung des Sommerkonzert findet alljährlich eine "Chorfahrt" nach Neuschliersee statt, an dem auch das Orchester teilnimmt. Die Leitung des Unterstufenensembles liegt in den Händen von Frau Szenthe, das Orchester leitet Frau Eblenkamp. Darüber hinaus wird Unterricht in Geige und Cello in Kleingruppen durch externe Fachlehrer angeboten.